Nom donné par certains chercheurs à l'ensemble hôte-microorganismes.

 La notion d'holobionte a été introduite en 2008 par Eugene Rosenberg et Ilana
 Zilber-Rosenberg avec leur théorie de l'hologénome, qui considère que l'unité
 de sélection évolutive n'est pas l'individu isolé mais l'holobionte.
 L'hologénome représente alors l'ensemble des gènes appartenant à l'hôte et aux
 microorganismes [10/2010].

 De nombreux exemples de coévolution montrent en effet que les microorganismes
 présents dans un hôte, tant à titre de parasite que de symbiote, peuvent avoir
 une influence considérable sur le comportement, voire le développement de leur
 hôte.