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Les collodictyons sont les seuls protozoaires à posséder 4 flagelles (tous les autres en possèdent un ou deux), laissant supposer que leur origine est très lointaine, peut-être même contemporaine de l'époque où la séparation entre les différents types de protozaires a eu lieu. Leurs plus proches cousins actuels sont les Excavata [05/2012].
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