Les deux domaines très proches de l'histochimie et de la cytochimie cherchent à
 comprendre les activités chimiques des tissus et des cellules. Par exemple, la
 présence de certaines couleurs au sein des cellules permet de déduire qu'une
 réaction chimique précise a eu lieu. En outre, la densité du coloris permet de
 déterminer l'intensité de la réaction.

 Les méthodes histochimiques se sont montrées particulièrement utiles dans
 l'étude des enzymes qui sont des substances qui catalysent et contrôlent de
 nombreuses activités de la cellule. La majeure partie de nos connaissances sur
 les enzymes a été obtenue en les étudiant après les avoir sorties de leur
 cellule d'origine. En outre, l'histochimie nous a permis de voir quelles
 cellules disposent de quelles enzymes, et de déterminer à quel point ces
 enzymes sont actives au sein de chaque cellule, sous des conditions extérieures
 diverses.

 Une importante technique d'histochimie repose sur l'utilisation des isotopes
 radioactifs d'éléments chimiques présents dans les cellules et les tissus. Ces
 éléments radioactifs "marqués" sont administrés à des organismes vivants,
 permettant au chercheur de suivre les éléments "normaux" à travers les tissus.
 Le degré de concentration d'éléments dans certaines couches cellulaires peut
 également être étudié par ce biais. Cette technique est appelée
 autoradiographie.

 Une autre technique est la microincinération. Elle consiste à brûler des
 éléments microscopiques de telle sorte que seuls leurs squelettes minéraux
 demeurent. On peut ensuite étudier ces squelettes à l'aide de processus
 chimiques appropriés. La microspectrophotométrie est un autre développement de
 l'histochimie; c'est une méthode précise d'étude des couleurs. Dans ce
 processus, les couleurs d'un tissu sont analysées au spectrophotomètre,
 instrument qui mesure l'intensité de chaque couleur en fonction des longueurs
 d'ondes. Cette technique permet des jugements précis sur la nature et
 l'intensité des réactions de couleurs, ce qui permet d'obtenir ensuite des
 informations détaillées sur le lieu et l'intensité des réactions chimiques dans
 un organisme vivant.